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我國科研人員成功繪制水稻全生命周期時空細胞圖譜

新華社海口10月7日電(記者陳凱姿)一粒稻種,從發芽到長出稻穗的整個過程,其內部就像一座龐大且精密的超級工廠,成千上萬的細胞,有的負責長根,有的負責結粒……它們需要在正確的時間和位置分工協作。

過去,科研人員難以看清水稻內部的詳細運作情況。現在,這一認知盲區被打破。崖州灣國家實驗室聯合華大生命科學研究院、華中農業大學、南方科技大學、武漢大學、中國科學院遺傳與發育生物學研究所等12家科研機構,構建了覆蓋水稻從種子萌發到開花結實全過程的三維時空細胞圖譜,為理解水稻生長發育、探索籽粒品質改良提供了新的研究資源。相關論文成果10月6日在線發表于國際學術期刊《細胞》。

科研人員以粳稻品種“中花11號”為材料,整合華大生命科學研究院自主研發的時空組學技術、單細胞組學技術、高通量基因測序儀等,建立了涵蓋水稻10類器官或組織、61個發育階段的圖譜。其間,科研人員獲取了超過85萬個高質量細胞核數據,以及超過34萬個空間數據單元,注釋出119種細胞類型和133個細胞亞型。

這些數據將水稻細胞的分子特征與空間位置相互對應,并呈現出不同發育階段的變化。有了這張“高清地圖”,科研人員可以觀察到不同細胞如何“打配合”并“拼裝”出一株完整水稻。

據介紹,該項科研突破與人們的餐桌息息相關。例如,大米主要是水稻的胚乳,它決定了米飯的口感和營養。研究發現,看起來渾然一體的胚乳,其內部細胞有著極其精細的“空間分工”,靠近“背部”處富集碳水化合物代謝和淀粉合成相關基因;靠近“腹部”處則更偏向于儲藏蛋白合成相關基因。此外,同一個關鍵調控因子,在不同的細胞空間環境里,也發揮著不一樣的功能。這意味著,未來科學家想要培育更好吃或更有營養的水稻,可以對照圖譜制定更有針對性的空間分區調控策略。

結合研究成果,科研人員還開發了水稻單細胞基礎模型,后續可供更有效識別、比較和復用數據,為關鍵基因挖掘和定向育種探索,提供重要研究線索。(完)

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